حمله کمک‌خلبان فلای‌دوبی به کاپیتان و سقوط شدید هواپیما، پرسش‌های مهمی درباره بررسی سوابق امنیتی خدمه، نحوه کنترل هواپیما پس از مجروح‌شدن خلبان و عبور کمک‌خلبان عمانی از کنترل‌های امنیتی اسرائیل ایجاد کرده است. روایت‌های منتشرشده درباره کنترل هواپیما توسط یک مسافر و زمان نماز پیش از حمله نیز با ابهام‌هایی روبه‌روست. با ادامه تحقیقات، هنوز انگیزه حمله و جزئیات دقیق حادثه روشن نشده است.
